最強錬金術師、F級ゴーレムに転生する

竜血錬金術の創始者にして、帝国一の天才錬金術師エイドリアン・ヴェインは、愛弟子のセバスチャン・クレイヴンに裏切られ殺されてしまう。しかし彼の魂は、廃棄されたF級アイアンゴーレム「A.V.001」に宿った。ゴーレムの体は錬成陣なしで錬金術を発動できると知った彼は、3年間、復讐を誓いながらスクラップで体を再錬成し続けた。そんな彼の隠れ家に、アカデミーを追放された落ちこぼれの少女、リーナ・ホロウェイが迷い込む。二人は奇妙な協力関係を結び、落ちこぼれの少女とポンコツのゴーレムという異色のコンビが誕生。彼らは帝国錬金術アカデミーに足を踏み入れ、やがて錬金術界を揺るがす大波乱を巻き起こしていく。